通山县境内溪沟纵横，河网密布。河道总长800余公里，河网密度每平方公里为300余米。主要河系5条（燕厦河、横石河、厦铺河、通羊河、黄沙河），流域面积2517平方公里，集水注入富水水库。年平均降水量45.3亿立方米，可利用水量25.4亿立方米。其中，本境地表径流20.5亿立方米，过境客水径流1.12亿立方米，地下水径流3.8亿立方米，地下水储量4.15亿立方米。山泉250处。在海拔1500余米的九宫山铜鼓凸、风车口山泉四时不涸，三源迎风台温泉，水温达50℃。境内有大型水库1座（富水水库），中型水库4座（石门、雨山、石门塘、望江岭），小（一）型水库13座，小（二）型水库61座，总库容0.995亿立方米（不含富水水库）。塘堰2810处，其中1万立方米以上大塘205处。境内水能蕴藏量为11万千瓦，可供开发量7.5万千瓦。